Sergio Civera @scivera

linkedin.com/in/sergio-cive… Joined March 2026

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Ah-Ram Kim @ahramkim1128

a month ago

🚀 New tool out! LIVIA (Local Interaction Visualization and Analysis) — a browser-based tool for assessing and visualizing predicted protein-protein interactions. Drop in a prediction from AlphaFold-Multimer, AF3, ColabFold, Boltz-1/2, Chai-1, or OpenFold3 (ZIP or folder, auto-detected) and LIVIA answers the two questions you actually care about: ▸ Do these proteins interact? ▸ Which residues form the interface? What you get: ▸ Interface confidence scores — iLIS (our local metric), ipSAE, actifpTM, ipTM ▸ Interaction interface heatmaps (PAE, LIS, cLIS) ▸ Sequence viewer + linear & circular contact maps highlighting Local Interaction Residues (LIR) and contact LIR (cLIR) ▸ Embedded Mol* 3D viewer ▸ Downloadable ChimeraX & PyMOL scripts Also fetches dimers directly from the AlphaFold Database — adding the interface annotations AFDB doesn't provide. Everything runs locally in your browser. No install, no upload. LIVIA started as a personal tool — I built it with Claude Code and used it to make every structure figure in our FlyPredictome preprint (Kim et al., 2026). (Claude Code is truly insane...) Along the way I realized it could be useful for others, too. If you have a favorite color palette for structure visualization, please let me know — happy to add it as a preset 🎨 🔗 LIVIA tool: flyark.github.io/LIVIA 🐍 iLIS / batch CLI: github.com/flyark/AFM-LIS 📄 LIVIA preprint: biorxiv.org/content/10.648… 📄 FlyPredictome preprint: biorxiv.org/content/10.648…

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CSIC @CSIC

a month ago

🧪 Una molécula inspirada en una planta carnívora degrada el gluten y evita los síntomas de la celiaquía 👨‍🔬Su desarrollo experimental. liderado por el @IBMB_CSIC y la @UniBarcelona podría ser la base de futuros tratamientos para la #celiaquía ➡️ tiny.cc/xye3101

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Sergio Civera @scivera

2 months ago

Las Jornadas Andaluzas de Bioinformática. Una experiencia muy enriquecedora para conocer el panorama actual del sector y conectar con la comunidad, intercambiando ideas y aprendiendo de distintos enfoques. ¡Nos vemos en Jaén! #bioinformatics #JABI2026

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B.M. Tubamirum @BMTubamirum

3 months ago

𝐂𝐎𝐍𝐂𝐈𝐄𝐑𝐓𝐎 𝐇𝐄𝐑𝐌𝐀𝐍𝐃𝐀𝐃 𝐌𝐄𝐑𝐂𝐄𝐃 | 𝐿𝑎 𝑀𝑖𝑠𝑖𝑜́𝑛 𝑑𝑒 𝑙𝑎 𝐸𝑠𝑝𝑒𝑟𝑎𝑛𝑧𝑎, de Rubén Jordán Flores, fue la marcha elegida para cerrar el concierto. youtu.be/xmSApOnNleg?is… @rjordanflores 📹 @SangreYlaGloria

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B.M. Tubamirum @BMTubamirum

4 months ago

𝐑𝐄𝐏𝐄𝐑𝐓𝐎𝐑𝐈𝐎 𝟐𝟎𝟐𝟔 | 𝑳𝒂 𝑴𝒊𝒔𝒊𝒐́𝒏 𝒅𝒆 𝒍𝒂 𝑬𝒔𝒑𝒆𝒓𝒂𝒏𝒛𝒂 pasa a formar parte de nuestro repertorio. La marcha fue compuesta en 2024 por @rjordanflores, con motivo de la misión evangelizadora que realizó la Virgen de la Esperanza de Triana el pasado año.